Moment, mir ist gerade eingefallen, das du die Zuweisung eventuell doch schon durchführen kannst, sofern du Version 0.9.5 verwendest.
Hierzu muesstest du in die Datei idoit/src/constants.inc.php gehen und dem Inhalt des ersten defines folgenden Wert hinzufügen: C__OBJECT_TYPE__GROUP
Also so:
define("C__SOFTWARE", "C__OBJTYPE__APPLICATION;C__OBJTYPE__SERVICE;C__OBJTYPE__OPERATING_SYSTEM;C__OBJECT_TYPE__GROUP");
Dann solltest du im Objekt Browser für die Zuweisung der Anwendung auch die Gruppe angezeigt bekommen. Allerdings wird die Gruppe an der Stelle leider nicht weiter aufgelöst, man müsste immer in die Gruppe hineingehen, um zu sehen welche Anwendungen darin verknüpft sind.