bitte beim Update keine Versionen überspringen da meist Änderungen an der Datenbank vorgenommen werden. Also erst das Update auf 0.9.8-3 und danach das Update auf die Version 0.9.9 machen.
Der Apache hat wahrscheinlich keine Rechte in dem i-doit htdocs Verzeichnis zu entpacken. Ich schlage vor du verwendest das Paket von unserer Webseite und entpackst es manuell in das ihtdocs/ Verzeichnis. Danach taucht das Paket unter "i-doit updates" (http://i-doit-url/updates) auf